Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SelenomQ8VHC3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms