Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sgip1Q8VD37 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sgip1Q8VD37 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sgip1Q8VD37 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgip1Q8VD37 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgip1Q8VD37 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgip1Q8VD37 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sgip1Q8VD37 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms