Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rapgef3Q8VCC8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rapgef3Q8VCC8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rapgef3Q8VCC8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rapgef3Q8VCC8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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