Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
0610009B22RikQ8R3W2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
0610009B22RikQ8R3W2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
0610009B22RikQ8R3W2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
0610009B22RikQ8R3W2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
0610009B22RikQ8R3W2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
0610009B22RikQ8R3W2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
0610009B22RikQ8R3W2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms