Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdk8Q8R3L8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdk8Q8R3L8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdk8Q8R3L8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms