Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Abca9Q8K449 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abca9Q8K449 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abca9Q8K449 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms