Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Vrk3Q8K3G5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Vrk3Q8K3G5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Vrk3Q8K3G5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Vrk3Q8K3G5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Vrk3Q8K3G5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Vrk3Q8K3G5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Vrk3Q8K3G5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Vrk3Q8K3G5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vrk3Q8K3G5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vrk3Q8K3G5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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