Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2G4

Bbs7, Bardet-Biedl syndrome 7 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs7Q8K2G4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bbs7Q8K2G4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bbs7Q8K2G4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bbs7Q8K2G4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs7Q8K2G4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs7Q8K2G4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms