Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34c1Q8K193 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34c1Q8K193 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn34c1Q8K193 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn34c1Q8K193 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34c1Q8K193 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cldn34c1Q8K193 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn34c1Q8K193 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c1Q8K193 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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