Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lmbrd1Q8K0B2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbrd1Q8K0B2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms