Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a8Q8JZR6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc4a8Q8JZR6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms