Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tshz3Q8CGV9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tshz3Q8CGV9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms