Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hpf1Q8CFE2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hpf1Q8CFE2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms