Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkl1Q8CEQ0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms