Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup88Q8CEC0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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