Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc178Q8CDV0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc178Q8CDV0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms