Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

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Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E4f1Q8CCE9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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E4f1Q8CCE9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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E4f1Q8CCE9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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E4f1Q8CCE9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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E4f1Q8CCE9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms