Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spef2Q8C9J3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spef2Q8C9J3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms