Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rft1Q8C3B8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rft1Q8C3B8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms