Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Amigo3Q8C2S7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Amigo3Q8C2S7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Amigo3Q8C2S7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Amigo3Q8C2S7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Amigo3Q8C2S7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
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