Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp44Q8C2S0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp44Q8C2S0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp44Q8C2S0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp44Q8C2S0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms