Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek11Q8C0Q4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek11Q8C0Q4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms