Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx16Q8C080 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx16Q8C080 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms