Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slx1bQ8BX32 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx1bQ8BX32 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slx1bQ8BX32 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms