Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmod1Q8BVA4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmod1Q8BVA4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmod1Q8BVA4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms