Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gpc2Q8BKV1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc2Q8BKV1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms