Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rspo4Q8BJ73 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rspo4Q8BJ73 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms