Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prox2Q8BII1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms