Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrtm2Q8BGX3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrtm2Q8BGX3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms