Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Katnb1Q8BG40 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Katnb1Q8BG40 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms