Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prima1Q810F0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prima1Q810F0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms