Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZW0

Stk35, Serine/threonine-protein kinase 35, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk35Q80ZW0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stk35Q80ZW0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk35Q80ZW0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms