Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkhd1l1Q80ZA4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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