Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ell3Q80VR2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ell3Q80VR2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms