Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrc1Q80VQ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrc1Q80VQ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms