Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Otop3Q80UF9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Otop3Q80UF9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms