Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3cQ80U95 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms