Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdc42bpbQ7TT50 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms