Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atf7ipQ7TT18 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf7ipQ7TT18 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atf7ipQ7TT18 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms