Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lamp3Q7TST5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lamp3Q7TST5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms