Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp6r1Q7TSI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms