Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms