Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prrc2bQ7TPM1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Prrc2bQ7TPM1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prrc2bQ7TPM1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms