Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tigd3Q7TM95 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tigd3Q7TM95 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms