Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssh1Q76I79 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms