Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SynmQ70IV5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SynmQ70IV5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SynmQ70IV5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms