Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnih3Q6ZWS4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnih3Q6ZWS4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms