Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RfflQ6ZQM0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RfflQ6ZQM0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms