Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

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Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp34Q6ZQ93 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp34Q6ZQ93 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp34Q6ZQ93 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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