Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd4Q6ZPR5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd4Q6ZPR5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms